1991年11月30日撤销晋县设立晋州市（县级）后，晋州市辖4镇16乡，行政区划无变化。1994年8月省政府批准，晋州市的东卓宿、桃园、营里、槐树、祁底5乡撤乡建镇，1995年1月1日始晋州市辖9镇11乡。1996年实行并乡扩镇，经省政府批准，晋州市设8镇2乡：晋州、总十庄、小樵、马于、东卓宿、桃园、营里、槐树8镇；东里庄、周家庄2乡；赵魏、元头、东宿、市区街道4个办事处，224个行政村，14个居委会。具体区划是：晋州镇辖21个行政村；营里镇辖12个行政村；总十庄镇辖总十庄、河头村两片，总十庄片13个行政村，河头村片8个行政村；桃园镇辖桃园、周头两片，桃园片14个行政村，周头片10个行政村；马于镇辖马于、杨家营两片，11个行政村；东卓宿镇辖东卓宿、陈家庄两个片，东卓宿片15个行政村；小樵镇辖小樵、田村两个片，小樵片12个行政村，田村片9个行政村；槐树镇辖槐树、祁底两个片，槐树片12个行政村，祁底片6个行政村；东里庄乡辖东里庄、东寺吕两个片，东里庄片14个行政村，东寺吕片13个行政村；周衣庄乡辖10个行政村；东宿办事处辖3个行政村。市区街道办事处辖14个居民委员会。
　　2000年，市区办辖17个居委会和华北石油、火车站2个家委会。其它乡镇办事处辖村无变化。本市实际仍按1995年的行政区划9镇11乡进行管理，市统计局仍按20个乡镇进行统计。

8镇

　　１：晋州镇辖21个行政村

　　２：营里镇辖12个行政村

　　３：总十庄镇辖:

　　　　　　　　总十庄片13个行政村，

　　　　　　　　河头村片8个行政村；

　　４：桃园镇辖:

　　　　　　　　桃园片14个行政村，

　　　　　　　　周头片10个行政村；

　　５：马于镇辖

　　　　　　　　马于片、

　　　　　　　　杨家营片

　　６：东卓宿镇辖

　　　　　　　　东卓宿片、

　　　　　　　　陈家庄片

　　７：小樵镇辖

　　　　　　　　小樵片12个行政村，

　　　　　　　　田村片9个行政村；

　　８：槐树镇辖

　　　　　　　　槐树片12个行政村，

　　　　　　　　祁底片6个行政村；

2乡

　　１：东里庄乡辖：

　　　　　　　　东里庄片14个行政村，

　　　　　　　　东寺吕片13个行政村；

　　２：周衣庄乡辖10个行政村；

4个办事处

　　１：赵魏办事处

　　２：元头办事处

　　３：东宿办事处辖3个行政村。

　　４：市区街道办事处辖17个居民委员会2个家委会